本实用新型提供了一种三层阳极微生物燃料电池净化装置,包括装置本体,装置本体上设有控制模块、泡沫板、数据采集模块和负载;装置本体两端分别均安装旋转机构,一个旋转机构上设有能伸缩的第一伸缩杆,另外一个旋转机构上设有能伸缩的第二伸缩杆,第一伸缩杆和第二伸缩杆上分别设有三层阳极和阴极,三层阳极由不锈钢网网载超级电容器活性碳电极设置为三层。本实用新型当伸长到一定的长度后控制旋转机构旋转使第一伸缩杆和第二伸缩杆绕其旋转机构旋转并最终使第一伸缩杆和第二伸缩杆连接的三层阳极和阴极垂直与装置本体,此时三层阳极和阴极伸入水中开始工作此过程在产生的电能为控制模块以及数据采集模块供电,供电的同时还能净化水质。